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数学物理学报, 2019, 39(6): 1545-1554 doi:

论文

一类具有信号分子调节作用的非连续模型的动力学性质

王茹, 张仲华,, 刘叶玲

Dynamical Properties of a Discontinuous Models with Signal Molecules Regulation

Wang Ru, Zhang Zhonghua,, Liu Yeling

通讯作者: 张仲华, E-mail: 941439353@qq.com

收稿日期: 2018-07-31  

基金资助: 陕西省自然科学基金.  2015JM1011

Received: 2018-07-31  

Fund supported: the Natural Science Foundation of Shaanxi Province.  2015JM1011

摘要

将信号分子的浓度作为指标,建立了一类描述病菌群体感应机理对信号分子浓度调节的非连续模型,讨论了模型滑动模块区域的存在性,真(假)平衡点和伪平衡点的存在性及稳定性.特别地,证明了穿越极限环的存在性.最后,运用Matlab软件进行数值模拟,支撑了理论结果.

关键词: 群体感应 ; 非连续模型 ; 滑模动力学 ; 极限环 ; 稳定性

Abstract

In this paper, the concentration of signal molecules is used as an indicator to establish a discontinuous model that describes the regulation of signal molecules concentration by the quorum sensing mechanism of pathogens. The existence of the sliding module region, the existence and stability of the true (false) equilibrium point and the pseudo equilibrium point are discussed. In particular, the existence of the crossing limit cycles is proved. Finally, the Matlab software is used to carry out numerical simulations to support the theoretical results.

Keywords: Quorum sensing ; Discontinuous model ; Sliding mode dynamics ; Limit cycles ; Stability

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本文引用格式

王茹, 张仲华, 刘叶玲. 一类具有信号分子调节作用的非连续模型的动力学性质. 数学物理学报[J], 2019, 39(6): 1545-1554 doi:

Wang Ru, Zhang Zhonghua, Liu Yeling. Dynamical Properties of a Discontinuous Models with Signal Molecules Regulation. Acta Mathematica Scientia[J], 2019, 39(6): 1545-1554 doi:

1 引言

1970年, Nealson等人[1]研究发现,当哈氏弧菌种群浓度达到一定阈值时,会产生生物体发光现象. 1999年,为描述致病因素的产生过程, Bassler[2]提出了群体感应的概念,它是一种以基因调控为基础的细菌间交流机制,细胞产生和分泌信号分子(AHL),并根据AHL浓度变化调节自身行为.文献[3]指出在细菌种群中,当AHL达到一定浓度时,群体感应现象才会发生.大量的研究[4-6]证实了这一观点.因此,微生物种群群体感应的发生过程具有很强的非连续性.

近年来,国内外学者通过研究病菌群体感应机理建立相关模型,并对模型进行动力学分析.例如, Müller等人[7]为描述群体感应现象,建立了一类细菌单细胞内AHL产生路径的连续型常微分方程(ODE)模型,刻画了细胞内AHL监管网络体系结构,讨论了模型的动力学性质. 2011年Hooshangi等人[8]针对群体感应发生过程中酶、AHL等物质浓度变化建立了一类连续型ODE模型,数值实验发现细胞内物质合成受AHL浓度的影响.之后, Barbarossa等人[9]针对恶臭假单胞菌种群群体感应现象,建立了一类具有正反馈调节和时滞的负反馈调节的连续型时滞微分方程(DDE)模型,研究了在群体感应作用下, AHL与其分解酶之间的相互作用关系,并对模型进行动力学分析和数值模拟.

基于文献[9],本文拟考虑群体感应发生过程的非连续性的特点,建立一类群体感应机理对AHL浓度调节的非连续ODE模型,讨论模型各类平衡点的存在性、稳定性及其在不连续分界面上的动力学性态.

2 模型的建立

文献[9]中分别记x(t), y(t)为恶臭假单胞菌种群AHL与其分解酶的浓度, α, γ, δ分别表示AHL的基础生产率、衰退率和分解率, ω表示AHL分解酶的衰退率.群体感应对AHL与其分解酶的调节作用分别遵循希尔函数Λ(x)=βx(t)nxnth+x(t)n, Φ(x)=ρx(tτ)mymth+x(tτ)m,其中β, ρ分别表示群体感应发生时AHL的额外生产率和AHL分解酶的生产率, xth, yth分别表示正反馈调节AHL与其分解酶的临界浓度, τ表示AHL分解酶产生的滞后时间, m, n表示希尔函数系数,建立了如下模型

{dx(t)dt=αγxδxy+βx(t)nxnth+x(t)n,dy(t)dt=ρx(tτ)mymth+x(tτ)mωy.
(2.1)

显然模型(2.1)未考虑群体感应现象何时发生.本文忽略时滞作用,假设群体感应现象发生的非连续性,研究在连续培养基中AHL与其分解酶浓度之间的关系.为此,假设x0为群体感应发生的临界浓度,当AHL浓度小于x0时,不发生群体感应现象, AHL浓度因初始生产率发生变化;当AHL浓度大于x0时,发生群体感应现象, H1(x),H2(x)分别为控制AHL额外生产率与AHL分解酶生产率的非连续函数,并遵循希尔函数变化.本文令m=n=1, xth=yth=k,即有Λ(x)=Φ(x)=xk+x,得到如下非连续模型

{dx(t)dt=αγxδxy+H1(x)Λ(x),dy(t)dt=H2(x)Φ(x)ωy,
(2.2)

其中H1(x)={β,x>x0,0,x<x0,H2(x)={ρ,x>x0,0,x<x0.

x<x0时, AHL与其分解酶浓度满足

{dx(t)dt=αγxδxy:=M1,dy(t)dt=ωy:=N1.
(2.3)

x>x0时, AHL与其分解酶浓度满足

{dx(t)dt=α+βxk+xγxδxy:=M2,dy(t)dt=ρxk+xωy:=N2.
(2.4)

在二维空间定义函数f(P)=xx0,其中P=(x,y).故系统(2.3)和(2.4)可表示为

P(t)={FS1(P),PS1,FS2(P),PS2,
(2.5)

其中S1={PR2:f(P)<0},S2={PR2:f(P)>0},FS1(P)=(M1,N1),FS2(P)=(M2,N2).

Σ={PR2:f(P)=0},则Σ为分割两个区域S1S2的边界.

3 平衡点的存在性与稳定性

首先研究模型(2.3)和(2.4)平衡点的存在性及稳定性.

3.1 系统(2.3)的动力学性质

为了讨论方便,引入如下符号

R0=γkα+γωβαδρ.

令系统(2.3)右端等于零,则其平衡点满足如下代数方程组

{αγxδxy=0,ωy=0.
(3.1)

定理3.1  系统(2.3)存在唯一的局部渐近稳定的平衡点E1=(x1,0),其中x1=αγ.

  系统(2.3)在点E1处的Jacobi矩阵为

J(E1)=[γδαγ0ω].

其特征根λ1=γ<0,λ2=ω<0.根据Routh-Hurwitz判据,平衡点E1局部渐近稳定.证毕.

定理3.2  系统(2.3)在R2+内无极限环.

  显然R2+区域为单连通区域,对于R2+区域内的轨线,根据Bendixson-Dulac判别法,选取Dulac函数A=1xy,则有

(AM1)x+(AN1)y=αx2y<0.

可知系统(2.3)不产生极限环.

结合定理3.1和3.2,有如下结论.

定理3.3  系统(2.3)存在唯一的正平衡点E1全局渐近稳定.

3.2 系统(2.4)的动力学性质

令系统(2.4)右端等于零,则其平衡点满足如下代数方程组

{α+βxk+xγxδxy=0,ρxk+xωy=0.

整理得

A1x2A2xA3=0,
(3.2)

其中A1=γω+δρ, A2=αωγωk+βω, A3=αωk.由于方程(3.2)根的判别式Δ=A22+4A1A3=(αωγωk+βω)2+4αωk(γω+δρ)>0,故存在两个不等的实根x2=A2+A22+4A1A32A1, x3=A2A22+4A1A32A1.

定理3.4  当R0<1时,系统(2.4)存在唯一的正平衡点E2=(x2,ρx2ω(k+x2))全局渐近稳定.

  系统(2.4)在点E2处的Jacobi矩阵为

J(E2)=(βk(k+x2)2γδρx2ω(k+x2)δx2ρk(k+x2)2ω),

其特征方程为

[λ+δρx2ω(k+x2)βk(k+x2)2+γ](λ+ω)+δρkx2(k+x2)2=0.
(3.3)

整理得

(k+x2)2ωλ2+pλ+q=0,
(3.4)

其中p=δρx22+δρkx2βkω+ω2(k+x2)2+ωγ(k+x2)2,q=ω(δρx22+2δρkx2βkω)+γω2(k+x2)2.

λ3,λ4为方程(3.4)的根,要证明平衡点E2的局部渐近稳定性,只需证明

λ3+λ4=p(k+x2)2ω<0,λ3λ4=q(k+x2)2ω>0.
(3.5)

事实上,为了证明p,q均为正,只需证明

δρkx2βkω>0.
(3.6)

x2代入式(3.6)左端,整理得

δρkx2βkωδρkA2A1βkω=ωk(1R0)γω+δρ.
(3.7)

R0<1时, (3.7)式右端大于零, (3.6)式成立,从而(3.5)式成立,故特征方程(3.4)的根均具有负实部,正平衡点E2局部渐近稳定.

根据Bendixson-Dulac判别法,选取Dulac函数A=1xy,则有

(AM2)x+(AN2)y=αx2yβ(k+x)2yρ(k+x)y2<0.

故系统(2.4)不产生极限环,正平衡点E2全局渐近稳定.

下面讨论平衡点的真假性.首先比较x1,x2的大小,不妨设x1x2,则有

αγA2+A22+4A1A32A1.

整理得

A1α2A2αγA3γ2,

即有

αδρβωγ0.
(3.8)

(3.8)式与R0<1矛盾,故有如下结论.

定理3.5   (ⅰ)当x2<x1<x0时, E1为真平衡点, E2为假平衡点,记为E1R,E2V;

(ⅱ)当x2<x0<x1时, E1,E2均为假平衡点,记为E1V,E2V;

(ⅲ)当x0<x2<x1时, E1为假平衡点, E2为真平衡点,记为E1V,E2R.

3.3 系统(2.5)的动力学性质

本节研究系统(2.5)伪平衡点的存在性、稳定性和极限环的存在性.

3.3.1 系统(2.5)滑线区域的存在性与伪平衡点的局部稳定性

定义在区域Si(i=1,2)中的向量场称为向量场FSi(i=1,2),并通过向量场FSi(i=1,2)定义了局部解轨线.为了把解轨线延拓到区域Σ上,首先将区域Σ做如下划分

(a)穿越区域: Σc={PΣ:FS1f(P)FS2f(P)>0},

(b)滑动区域: Σs={PΣ:FS1f(P)>0,FS2f(P)<0},

(c)逃逸区域: Σe={PΣ:FS1f(P)<0,FS2f(P)>0},

其中FSif(P)=FSi(P)gradf(P)表示f关于向量场FSi在点P处的Lie导数.滑动区域和逃逸区域统称为滑动模式区域.

对于系统(2.5),由计算得穿越区域Σc={PΣ:y>y20<y<y1},滑动区域Σs不存在;逃逸区域Σe={PΣ:y1<y<y2}.由此,得到系统滑动模式区域ΣS={PΣ:y1<y<y2},其中y1=αγx0δx0,y2=αγx0δx0+βδ(k+x0).

在滑动模式区域ΣS上,局部解轨线通过Filippov系统的凸组合定义,考虑系统

ZS(P)=μFS1+(1μ)FS2,μ(0,1).

ΣS上有ZS(P)f(P)=0,即

μ(αγxδxy)+(1μ)(αγxδxy+βxk+x)=0,

其中μ=FS2f(P)FS2f(P)FS1f(P)=(αγxδxy)(k+x)+βxβx.

由此可得

ZS(P)=1FS1f(P)FS2f(P)(FS1f(P)FS2(P)FS2f(P)FS1(P))=(0φ(y)),

其中φ(y)=(δρx0βω)yρβ(αγx0).

下面讨论伪平衡点的存在性及稳定性.不妨设EP=(x0,y),y[y1,y2],且满足

φ(y)=0.
(3.9)

x0βωδρ时,解方程(3.9)得y=ρ(αγx0)δρx0βω.

定理3.6  当x2<x0<x1时,存在不稳定的伪平衡点EP.

  若伪平衡点EP存在,则有y[y1,y2]成立,由y1,y2的定义经计算可得x2<x0<x1x1<x0<βωδρ.由(3.6)式得x2>βωδρ,则当R0<1时,有x1>βωδρ+k.从而当x2<x0<x1时,伪平衡点EP存在.注意到

φ(y)y|y=yP=ω+ρδx0β>0.

故系统(2.5)的伪平衡点存在但不稳定.

边界平衡点满足f(P)=0FS1(P)=0FS2(P)=0,由此可得系统(2.5)存在两个边界平衡点E1B=(x0,0),E2B=(x0,ρx0ω(k+x0)).切点满足PΣFS1f(P)=0FS2f(P)=0,αγxδxy=0α+βxk+xγxδxy=0.故系统(2.5)的两个切点E1T=(x0,y1),E2T=(x0,y2).

3.3.3 系统(2.5)极限环的存在性

(x(t),y(t))为系统(2.5)的解轨线,为研究极限环的存在性,首先给出如下引理.

引理3.1  在S1区域, y(t)单调递减且恒大于0;当x(t)<x0<x10<y(t)<y1时, x(t)单调递增.

  在S1区域,根据系统(2.3)的第二式y(t)=y0eω(tt0),其中y0>0,ω>0.y(t)单调递减且恒大于0.

x<x0时,根据系统(2.3)的第一式得

dx(t)dt=αγxδxy>αγx0δx0y.

显然,当y(t)<y1时, dx(t)dt>0, x(t)单调递增.又因为y(t)恒大于零,故x0<x1.因此当x(t)<x0<x10<y(t)<y1时, x(t)单调递增.

引理3.2  在S2区域,当x(t)>α+βγ时, x(t)单调递减;当y(t)>ρω时, y(t)单调递减.

  在S2区域,根据系统(2.4)的第一式得

dx(t)dt=α+βxk+xγxδxyα+βγx

x(t)>α+βγ时, dx(t)dt<0, x(t)单调递减.

根据系统(2.4)的第二式得

dy(t)dt=ρxk+xωyρωy.

故当y(t)>ρω时, dy(t)dt<0, y(t)单调递减.

注3.1  对于系统(2.4),根据引理3.2,区域S2有界.

定理3.7  当x2<x0<x1时,系统(2.5)存在环绕滑动模式区域的穿越极限环.

  首先排除其它类极限环的存在性.

(ⅰ)根据定理3.3和3.4,系统(2.5)不存在全部位于区域S1S2内的极限环.

(ⅱ)系统(2.5)不存在与滑线相切或包含一部分滑线的极限环.为排除此类极限环的存在性,只需证明始于切点的轨线不会再次到达滑线.对于系统(2.3),记垂直等倾线为gx1={(x,y)|y=αγxδx},水平等倾线为gy1={(x,y)|x=x1};对于系统(2.4),记垂直等倾线为gx2={(x,y)|y=αγxδx+βδ(k+x)},水平等倾线为

gy2={(x,y)|x=ωykρωy,yρω}.

情形一  当x2<x0<x1时, E1,E2均为假平衡点,伪平衡点EP存在但不稳定.

在滑线¯E1TEP上, φ(y)<0,轨线在滑线上的方向为从右向左;在滑线¯EPE2T上, φ(y)>0,轨线在滑线上的方向为从左向右.通过对系统(2.5)的讨论和计算,得其向量场如图 1所示.

图 1

图 1   Filippov系统向量场


下面证明从切点E1T出发的轨线不会再次到达滑线.首先证明不存在与切点E2T相切的极限环.如果在S2区域存在与E2T相切的极限环,又没有真平衡点存在,所以矛盾.其次在区域Σ上,切线¯E1TE2T构成逃逸区域,并根据S2区域向量场的方向,故从切点E1T出发的轨线不能再次到达滑线.同理可证从切点E2T出发的轨线不会再次到达滑线.从而不存在与滑线相切或包含一部分滑线的极限环.

情形二  当x0<x2<x1时,伪平衡点Ep不存在, E1为假平衡点, E2真平衡点.

在滑线¯E1TE2T上, φ(y)>0恒成立,轨线在滑线上的方向为从左向右.下面证明始于切点E2T的轨线不会再次到达滑线.平衡点E2是稳定的结点或焦点取决于特征方程(3.4)的判别式Δ=p24(k+x2)2ωq的符号.若为结点,则从E2T出发的轨线直接趋向于E2R,不会形成极限环;若为焦点,则从E2T出发的轨线盘旋趋近于E2R,亦不会形成极限环,从而不存在与滑线相切或包含一部分滑线的极限环.

情形三  当x0>x1>x2时, E1为真平衡点, E2为假平衡点,伪平衡点Ep不存在,利用类似情形二的方法即可证明.

(ⅲ)系统(2.5)不存在环绕穿越区域的穿越极限环.

系统(2.5)的穿越区域Σc={PΣ:y>y20<y<y1}.根据其向量场分布,当0<y<y1时,轨线由S1区域穿越横截面方向向上,不会形成极限环.当y>y2时,轨线由S2区域穿越横截面方向向下,不能形成极限环,从而不存在环绕穿越区域的穿越极限环.

接下来,证明系统(2.5)环绕滑动模式区域的穿越极限环的存在性.

(ⅳ)当x2<x0<x1时,系统(2.5)存在环绕滑动模式区域的穿越极限环.

x2<x1<x0时,系统(2.5)不存在全局吸引子,并根据引理3.1和3.2,从而在该条件下可能出现极限环.同时根据(ⅰ)–(ⅲ)排除了其他类极限环的存在,故当x2<x1<x0时,系统系统(2.5)存在环绕滑动模式区域的穿越极限环.

4 数值模拟

系统(2.5)存在一类新的周期解,即周期轨线与分界线横截相交并穿过分界面Σ形成环绕滑动模式区域的穿越极限环,详见文献[10-11].接下来,利用数值实验验证理论结果.系统(2.5)的参数值见表 1.

表 1   系统(2.5)的参数值

参数参数
α0.10564ρ50
γ10ω10
δ30k0.003
δ1.0564

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选取分支参数x0,当R0<1时,系统(2.5)的动力学性质如下.

(ⅰ)当x0=0.006,即x0<x2<x1时,系统(2.5)存在假平衡点E1V和真平衡点E2R,伪平衡点EP不存在,真平衡点E2R渐近稳定.在这种情况下,初值解先增大后减小或穿越不连续面最终收敛到真平衡点E2R, AHL浓度始终控制在阈值浓度x0之上(如图 2).当群体感应发生时, AHL与其分解酶的浓度随着时间变化最终趋于稳定的真平衡点E2R (如图 3图 4).

图 2

图 2   初值解最终收敛到E2R


图 3

图 3   AHL浓度与t的关系


图 4

图 4   分解酶浓度与t的关系


(ⅱ)当x0=0.008,即x2<x0<x1时,系统(2.5)存在两个假平衡点E1V,E2V,伪平衡点EP存在但不稳定.此时系统(2.5)不存在全局吸引子,存在一个稳定的环绕滑动模式区域的穿越极限环,所有的环外面的解都趋近于这个极限环(如图 5).当群体感应发生时, AHL与其分解酶的浓度随着时间变化均呈现出周期性变化(如图 6图 7).

图 5

图 5   系统(2.5)的极限环


图 6

图 6   AHL浓度与t的关系


图 7

图 7   分解酶浓度与t的关系


(ⅲ)当x0=0.06,即x2<x1<x0时,系统(2.5)存在真平衡点E1R和假平衡点E2V,伪平衡点EP不存在,真平衡点E1R渐近稳定.在这种情况下,初值解逐渐减小或穿越不连续面最终收敛到真平衡点E1R, AHL浓度始终控制在阈值浓度x0之下(如图 8).当群体感应发生时, AHL与其分解酶的浓度随着时间变化最终趋于稳定的真平衡点E1R(图 9图 10).

图 8

图 8   初值解最终收敛到E1R


图 9

图 9   AHL浓度与t的关系


图 10

图 10   分解酶浓度与t的关系


5 结论

本文建立了一类具有非连续函数的群体感应对AHL浓度调节的数学模型,并讨论了其动力学性质.当R0<1时,平衡点E2全局渐近稳定;当x0<x2<x1时,伪平衡点EP不存在,真平衡点E2R渐近稳定,初值解最终直接或穿越不连续面收敛到真平衡点E2R;当x2<x0<x1时, E1,E2均为假平衡点,伪平衡点EP存在但不稳定,此时系统(2.5)存在一个稳定的环绕滑动模式区域的穿越极限环,所有的环外面的解都趋近于这个极限环;当x2<x1<x0时,伪平衡点EP不存在,真平衡点E1R渐近稳定,初值解最终直接或穿越不连续面收敛到真平衡点E1R.

与文献[9]的结果相比较,由于非连续函数的引入,使模型中出现了真、假、伪平衡点及穿越极限环等更加丰富的动力学性态.研究结果表明AHL与其分解酶的浓度在群体感应的调节作用下,最终趋于某一状态.

参考文献

Nealson K H , Platt T , Hastings J W .

Cellular control of the synthesis and activity of the bacterial luminescent system

Journal of Bacteriology, 1970, 104: 313- 322

URL     [本文引用: 1]

Bassler B L .

How bacteria talk to each Other:regulation of gene expression by quorum sensing

Current Opinion in Microbiology, 1999, 2: 582- 587

DOI:10.1016/S1369-5274(99)00025-9      [本文引用: 1]

Dockery J D , Keener J P .

A mathematical model for quorum sensing in pseudomonas aeruginosa

Bulletin of Mathematical Biology, 2001, 63: 95- 116

DOI:10.1006/bulm.2000.0205      [本文引用: 1]

Yarwood J M , Bartels D J , Volper E M , et al.

Quorum sensing in staphylococcus aureus biofilms

Journal of Bacteriology, 2004, 186: 1838- 1850

DOI:10.1128/JB.186.6.1838-1850.2004      [本文引用: 1]

Whitehead N A , Barnard A M L , Slater H , et al.

Quorum-sensing in gram-negative bacteria

Fems Microbiology Reviews, 2001, 25: 365- 404

DOI:10.1111/j.1574-6976.2001.tb00583.x     

Rumbaugh K P .

The role of quorum sensing in the in vivo virulence of Pseudomonas aeruginosa

Microbes Infect, 2000, 2: 1721- 1731

DOI:10.1016/S1286-4579(00)01327-7      [本文引用: 1]

Müller J , Kuttler C , Hense B A , et al.

Cell-cell communication by quorum sensing and dimension-reduction

Journal of Mathematical Biology, 2006, 53: 672- 699

DOI:10.1007/s00285-006-0024-z      [本文引用: 1]

Hooshangi S , Bentley W E .

LsrR quorum sensing "Switch" is revealed by a bottom-up approach

Plos Computational Biology, 2011, 7: 1- 11

URL     [本文引用: 1]

Barbarossa M V , Kuttler C .

Mathematical modeling of bacteria communication in continuous cultures

Applied Sciences, 2016, 6: 149- 165

DOI:10.3390/app6050149      [本文引用: 4]

王爱丽.基于不同控制策略的非光滑传染病模型研究[D].西安:西安交通大学, 2015

[本文引用: 1]

Wang A L. On Non-smooth Epidemic Model with Various Threshold Policy Study on Some Mathmatical Problem[D]. Xi'an: Xi'an Jiaotong University, 2015

[本文引用: 1]

覃文杰.有限资源下非光滑生物系统理论与应用研究[D].西安:陕西师范大学, 2015

URL     [本文引用: 1]

Qi W J. Study on Non-smooth Biosystem of Theory and Application Under Resource Limitation[D]. Xi'an: Shaanxi Normal University, 2015

URL     [本文引用: 1]

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