原子电性作用矢量用于氨基酸化学位移计算

波谱学杂志 ›› 2005, Vol. 22 ›› Issue (2): 163-172.

原子电性作用矢量用于氨基酸化学位移计算

1.重庆大学生物医学工程教育部与重庆市重点实验室； 2.重庆大学化学化工学院；  3.重庆大学生物工程学院，重庆 400044

收稿日期:2004-11-29 修回日期:2005-02-21 出版日期:2005-06-05 发布日期:2005-06-05
基金资助:
霍英东基金(1998-7-6)，国家春晖计划教育部启动基金(1999-1-4/38)及重庆大学创新基金(2003-5-6)资助项目.

Calculation of ¹³C Chemical Shifts of Amino Acids Using Atomic Electronegativity Interaction Vector

1.Key Laboratory of Biomedical Engineering of Ministry of Education and Chongqing City, Chongqing 400044, China; 
2.College of Chemistry and Chemical Engineering, Chongqing University, Chongqing 400044, China; 
3.College of Bioengineering, Chongqing University, Chongqing 400044, China

Received:2004-11-29 Revised:2005-02-21 Online:2005-06-05 Published:2005-06-05
Supported by:
霍英东基金(1998-7-6)，国家春晖计划教育部启动基金(1999-1-4/38)及重庆大学创新基金(2003-5-6)资助项目.

摘要/Abstract

摘要：

提出了用于表征分子内部化学微环境的结构描述子：原子电性作用矢量(AEIV)，并将其应用于20个天然氨基酸103个¹³C 原子核磁共振化学位移CS建模：δ =-190.514+7.352×ν₁+63.998×ν₂+49.252×ν₃+39.678×ν₄，取得优良效果. 模型值、留一法(LOO)和留分法(LMO)交互校验的复相关系数分别为R_MM=0.966 0, RLOO=0.957 7和R_LMO=0.957 7.

关键词: ¹³C NMR, 定量结构波谱关系, 原子电性作用矢量, 氨基酸, 化学微环境

Abstract:

A novel method based on atomic electronegativity interaction vector (AEIV) was developed to describe chemical environment and atomic state in amino acids, and to predict ¹³C chemical shifts. One hundred and three ¹³C chemical shifts for twenty natural amino acids were calculated by the method. The precision of calculation is cross-validated using the chemical shifts calculated by established methods, including molecular modeling, the leave-one-out (LOO) method and the leave-molecule-out (LMO) method. The correlation coefficients (R) obtained are R_MM=0.966, R_LOO=0.958 and R_LOO=0.950, respectively. The model developed was also applied to predict fifteen ¹³C NMR chemical shifts for two newly discovered natural amino acids.

Key words: nuclear magnetic resonance, ¹³C NMR, atomic electronegativity interaction vector, amino acid, chemical shif

中图分类号:

O641.12

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